Hledej
Zobraz:
Univerzity
Kategorie
Rozšířené vyhledávání
12 659 projektů
0 nových
Analýza biologických sekvencí
«»
| Přípona .docx |
Typ projekt |
Stažené 0 x |
| Velikost 0,1 MB |
Jazyk český |
ID projektu 7599 |
| Poslední úprava 07.03.2016 |
Zobrazeno 712 x |
Autor: nella.grundzova |
Sdílej na Facebooku |
||
| Detaily projektu | ||
- Cena:
4 Kreditů - kvalita:
77,2% -
Stáhni
- Přidej na srovnání
- Univerzita:Vysoké učení technické v Brně
- Fakulta:Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
- Kategorie:Technika » Elektrotechnika
- Předmět:Analýza biomedicínských obrazů
- Studijní obor:-
- Ročník:4. ročník
- Formát:MS Office Word (.docx)
- Rozsah A4:9 stran
Zadání
Vytvořte funkci pro vykreslení “nejlepšího“ fylogenetického stromu metodou UPGMA. Srovnejte Pearsonův korelační koeficient u stromů vykreslených pro model Jukes-Cantor s gama korekcí v rozmezí <0,65 - 3>. Výstupem bude strom vyhodnocený automaticky pro nejlepší korelační koeficient. Otestujte na 20 proteinových sekvencích Hemoglobinu (po pěti od každé skupiny: alfa, beta, gama, delta). Na každou skupinu zvlášť i na všech 20 dohromady.
Vytvořte funkci pro vykreslení “nejlepšího“ fylogenetického stromu metodou UPGMA. Srovnejte Pearsonův korelační koeficient u stromů vykreslených pro model Jukes-Cantor s gama korekcí v rozmezí <0,65 - 3>. Výstupem bude strom vyhodnocený automaticky pro nejlepší korelační koeficient. Otestujte na 20 proteinových sekvencích Hemoglobinu (po pěti od každé skupiny: alfa, beta, gama, delta). Na každou skupinu zvlášť i na všech 20 dohromady.
Klíčová slova:
fabs
biologické sekvence
fylogenetický strom
hemoglobin
matice
Obsah:
- Zadání
Teoretický rozbor
Popis metody
Výsledky
Diskuze
Ukázka zdrojového kódu
Závěr